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解读 | lncRNA与血管内皮细胞凋亡过程的是是非非

作者:北京博奥晶典生物技术有限公司 2017-02-19T08:42 (访问量:6159)

                          解读 | lncRNA与血管内皮细胞凋亡过程的是是非非

 

-博奥晶典科研服务-ncRNA,lncRNA研究领域新发现!

研究背景

近年来,越来越多的证据表明lncRNA(长链非编码RNA)可以通过多个水平改变基因的表达,进而在生物过程中起到关键调节子的作用。血管内皮细胞的凋亡与多种心血管疾病相关联,如动脉粥样硬化和血栓形成等。然而在心血管系统中的lncRNA研究才刚刚起步。到目前为止,在血管内皮细胞中还没有发现与抗凋亡相关的lncRNA。

来自山东大学苗俊英(教授)课题组的路玮等,利用博奥晶典的lncRNA芯片发现LOC100129973能够作为miRNA海绵体,与miRNA-4707-5p和miRNA-4767miRNA结合,最终降低由于血清和生长因子缺乏所引起的血管内皮细胞的凋亡。该lncRNA作为血管内皮细胞凋亡的抑制剂,为确定内皮细胞凋亡相关心血管疾病治疗的新靶点提供证据。相关结果发表在2016年的Scientific Reports上IF=5.525)。

本研究中,北京博奥晶典生物技术有限公司提供了lncRNA芯片检测服务和生物信息分析服务。

技术路线

结果展示

1. 三种培养条件下,加入ABO可以抑制饥饿引起的血管内皮细胞的凋亡

作者对血管内皮细胞培养采用三种条件,发现ABO存在的情况下,可抑制因为饥饿导致的细胞凋亡。

 

图注:Nor:正常培养; Ctr:去血清去生长因子诱导内皮细胞凋亡;ABO:去血清去生长因子的条件下加入ABO;

 

三种实验分析血管内皮细胞凋亡:A细胞形态观察;B 丫啶橙染色;C TUNEL染色。

2. ABO处理细胞时,差异表达基因筛选及验证

ABO培养条件下,长非编码RNA LOC100129973显著上调。

 

图注:左图:芯片筛选到的差异lncRNA情况; 右图:A.LOC100129973在基因组上的情况;B.3种培养条件下LOC100129973的RT-PCR结果。

3. 确定长非编码RNA LOC100129973对凋亡的作用

 

LncRNA LOC100129973可以抑制血管内皮细胞因血清和FGF-2饥饿诱导的细胞凋亡。

 

图注:A.LOC100129973过表达和敲低的RT-PCR验证;B.染色实验;C,D.切割切割PARP的Western Blot实验。

4. 长非编码RNA LOC100129973可以作为miRNA海绵体,负调控miRNA 4707-5p和miRNA 4767

lncRNA LOC100129973可发挥miRNA海绵体的作用,对两个miRNA进行调控。

 

小编说

血管内皮细胞的凋亡与多种心血管疾病相关联,如动脉粥样硬化和血栓形成等。越来越多的证据表明lncRNA可以通过多个水平改变基因的表达,进而在多个生物过程中起到关键调节子的作用;但目前在心血管系统中的长非编码RNA研究才刚刚起步,尚未发现在血管内皮细胞中抗凋亡的lncRNA。本研究发现的一个lncRNA能够抑制由于去血清去生长因子引起的血管内皮细胞的凋亡。而且该lncRNA能够作为miRNA海绵体,与miRNA-4707-5p和miRNA-4767这两个miRNA结合,进而上调两者的靶基,最终降低由于血清和生长因子缺乏所引起的血管内皮细胞的凋亡。

本文的研究证明lncRNA可作为提高内皮功能的有效靶标,也为确定内皮凋亡相关心血管疾病治疗的新靶点提供证据。

Reference

Lu, W., et al. Long Noncoding RNA LOC100129973 Suppresses Apoptosis by Targeting miR-4707-5p and miR-4767 in Vascular Endothelial Cells. Scientific Reports 6(2016).

作者简介

苗俊英 教授

武汉大学细胞生物学学士,武汉大学生物物理学硕士,名古屋大学理学博士。主要从事血管内皮细胞增殖、分化和凋亡分子机制研究,以及神经元存活与凋亡分子机制研究。现任山东大学教授,从事发育生物学和细胞生物学教学工作。多次承担国家重大的科研项目,并已获得多项发明**。

博奥晶典人lncRNA检测产品

晶芯®人类lncRNA V4.0芯片是博奥生物集团有限公司与中国科学院生物物理研究所陈润生院士课题组共同开发的人类长链非编码RNA(lncRNA)芯片。晶芯®人类lncRNA V4.0芯片已经完成食道癌、肺癌、肾细胞癌、肝癌、卵巢癌、甲状腺肿瘤、结肠癌、舌癌、胶质瘤、乳腺癌、宫颈癌等十余种肿瘤的相关研究,检测总样品数超过4500个,为224家单位提供了科研服务。科研服务助21家单位发表30篇文章,影响因子总计超过114分。晶芯®人类lncRNA V4.0芯片服务于2015年获得了北京市新技术新产品(服务)证书。

产品详情

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科研服务事业部 颜世磊、吴洁、张西轩 | 文案

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