文献解读|荣登Nature,清华大学刘玉乐团队揭示水杨酸甲酯介导的植物气传性免疫的分子机制及病毒的反防御机制-会议论文集-资讯-生物在线

文献解读|荣登Nature,清华大学刘玉乐团队揭示水杨酸甲酯介导的植物气传性免疫的分子机制及病毒的反防御机制

作者:北京索莱宝科技有限公司 2023-12-19T00:00 (访问量:13132)

文献背景

植物受到环境刺激时会释放挥发性化合物(VOCs)作为植物间的特殊沟通信号而被感知,进而诱导邻近植物产生防御反应,这种现象被称为气传性免疫(airborne defense,AD)。尽管几十年来在众多植物中已观察到这种植物间通讯(PPC)现象,并了解其生物学、生态学意义,然而包括AD在内的VOCs介导的PPC的分子机制仍不清楚。此外,除乙烯受体外,植物中介导VOC传感系统的受体也一直未确定。

蚜虫是世界上最具破坏性的农业和园艺害虫,以韧皮部为食,超过40%的植物病毒依靠蚜虫传播来感染植物,因此对作物生产造成了大规模的破坏。蚜虫侵害会诱导植物释放包含水杨酸甲酯(MeSA)、水杨酸结合蛋白-2(SABP2)、转录因子NAC2和水杨酸-羧甲基转移酶-1(SAMT1)在内的VOCs。MeSA在植物防御蚜虫等草食性昆虫侵害中发挥重要作用,包括驱除昆虫、吸引捕食者或降低昆虫的生存适应性等方式。MeSA被认为是植物内部和长距离移动信号,参与诱导对微生物病原体和食草昆虫的系统获得性抗性(SAR)。在SAR过程中,水杨酸(SA)在病原体感染的细胞中积累,并通过SAMT1转化为MeSA;然后,MeSA通过韧皮部进入远端组织,随后在未侵染叶中被SABP2重新转化为SA。虽然已知MeSA作为植物内SAR信号的功能,但MeSA如何作为植物间通讯的信号激活AD抗蚜虫防御是一个长期未解决的问题。植物是否拥有识别和感知空气中MeSA的受体也不清楚。此外,蚜虫和病毒能否干扰植物气传性免疫也未知。本研究揭示了AD的分子机制和蚜虫-病毒共同进化的共生关系,证明AD是控制蚜虫和病毒的潜在仿生策略

基本信息

题目:

Molecular basis of methyl-salicylatemediated plant airborne defence

期刊:

Nature

影响因子:64.8

DOI:

https://doi.org/10.1038/s41586-023-06533-3

通讯作者:

刘玉乐

作者单位:

清华大学等

索莱宝合作产品:

产品货号

产品名称

IB0100

6-苄氨基喋呤(6-BA)

IA1310

腺苷-5'-三磷酸

N8010

α-萘乙酸(NAA)



摘要

蚜虫是世界上最具破坏性的作物害虫之一,被蚜虫侵害的植物会释放挥发性化合物,以引起邻近植物的气传性免疫(AD)。本文揭示了MeSA、SABP2、转录因子NAC2和SAMT1形成了信号通路来介导邻近植物针对蚜虫和病毒的AD。空气中MeSA能够被MeSA受体蛋白水杨酸结合蛋白-2(SA-binding protein-2,SABP2)感知并转化为水杨酸(salicylic acid, SA)。水杨酸引起信号转导级联反应,SA激活转录因子NAC2,上调水杨酸羧基甲基转移酶1(SA-carboxylmethyltransferase-1,SAMT1)基因的表达,激活NAC2-SAMT1模块从而产生更多的MeSA,诱导植物的抗蚜虫免疫,从而降低病毒的传播。一些蚜虫传播病毒比如黄瓜花叶病毒、马铃薯Y病毒等能够编码含有解旋酶结构域的蛋白质,通过与NAC2蛋白相互作用来抑制AD,改变NAC2蛋白的亚细胞定位,促进NAC2在细胞质中被26S蛋白酶体降解,从而负调控NAC2-SAMT1通路,抑制MeSA的合成和挥发,阻断植物间“预警”通讯,促进蚜虫对邻近植物的侵染和对病毒的传播。本研究揭示了AD的分子机制和蚜虫-病毒共同进化的共生关系,表明AD是一种潜在的生物仿生策略,可以控制蚜虫和病毒的传播。

研究内容及结果

1. 验证植物抗病毒防御需要NAC2

作者通过免疫沉淀-质谱分析策略(IP-MS),成功鉴定了本氏猪笼草中黄瓜花叶病毒(CMV)的病毒发病机制过程中,核心蛋白CMV1a的相互作用蛋白组,并确定NAC2为CMV1a的重要相互作用因子,以进行后续实验(扩展数据图1a)。CMV1a-NAC2相互作用通过免疫共沉淀(co-IP)、双分子荧光(BiFC)和荧光素酶互补成像(LCI)试验进一步验证(扩展数据图1b-d)。为了评估NAC2是否影响CMV对NAC2.1/NAC2.2双敲除(KO)突变株的感染,通过比较CRISPR-cas9基因编辑(扩展数据图2a)产生的突变株(NAC2植株)和野生型(WT株)的感染结果,发现CMV感染导致NAC2突变株的症状更严重,病毒RNA和外壳蛋白(CP)的量更高(扩展数据图1e-g)。用GFP标记的马铃薯病毒Y或GFP标记的TMV(TMV-GFP)感染的突变株和野生型植株中也有类似的结果(扩展数据图1h-m)。这些数据表明,NAC2对植物抗病毒防御至关重要。

扩展数据图1


2. 证明NAC2通过MeSA介导AD对抗蚜虫

作者在研究中注意到,在NAC2叶子上定植的绿桃蚜虫数量比在WT叶子上的数量多得多,进一步研究了NAC2植株对蚜虫吸引力的作用。作者进行了圆形培养皿和Y管嗅觉仪生物测定,发现NAC2植株比WT植株吸引了更多的蚜虫,推测这可能是由空气传播信号介导的(扩展数据图1n-o)。作者使用气相色谱法与MS(GC-MS)相结合来鉴定蚜虫侵袭的WT植株与NAC2植株释放的挥发物。而MeSA是蚜虫侵袭WT植株与NAC2植株唯一产生差异的VOC,并且蚜虫侵染后WT释放的MeSA多于NAC2植株(扩展数据图2e-h)。MeSA是有据可查的可诱发蚜虫的VOC10-13主要挥发物。为了测试NAC2植株对蚜虫吸引力的影响是否归因于MeSA的挥发,研究人员使用GC-MS测量了对蚜虫侵袭的WT植株在空气中MeSA的排放率,发现每个蚜虫侵袭的WT植株MeSA的排放率为34ng h−1(相当于每天排放0.816µg)(扩展数据图2f)。此外,研究人员发现,含有0.8µg MeSA/羊毛脂处理的植株与蚜虫侵袭的WT植株有相似的MeSA排放(扩展数据图2i,j)。因此,研究人员使用0.8µg MeSA/羊毛脂涂抹对植株进行处理,结果表明NAC2和WT植株对蚜虫表现出相似的吸引力(扩展数据图1p,q)。然而,当单独用羊毛脂或羊毛脂与其他挥发物(如3,3-二甲基己烷)处理时,NAC2植株比WT植株对蚜虫更具吸引力(扩展数据图1r,s)。研究人员将NAC2和WT植株置于挥发性MeSA下24 h,然后通风2h,并比较了气态MeSA如何影响植株对蚜虫的吸引力。在这样的条件下,WT植株对蚜虫的驱避性更强(扩展数据图1t,u)。然而,在通风和不进行挥发性MeSA处理后,NAC2植株之间的蚜虫驱避性没有明显差异(扩展数据图1v,w)。此外,与未进行MeSA处理时观察到的情况一样,在MeSA处理下,与挥发性MeSA处理随后通风的WT植株相比,NAC2植株对蚜虫的吸引力仍然更大(扩展数据图 1x,y)。

为了解释这种现象背后的原因(扩展数据图1t-y),研究人员用挥发性MeSA处理NAC2或WT植株24 h,然后通风,量化接收植株(接收器)排放的挥发性MeSA。WT植株反而在空气中释放出更高水平的MeSA(图1a,b)。随后研究人员比较了蚜虫MeSA接收植株与模拟WT植株在涂抹后的吸引力,所有植株都含有MeSA/羊毛脂,但发现它们在蚜虫偏好方面没有差异(图1c,d)。此外,在用MeSA/羊毛脂涂抹NAC2和WT接收植株后,这些MeSA接收植株还同样吸引蚜虫(图1e,f)。接下来,研究人员以蚜虫侵袭的植物为发射植株(发生源),研究了NAC2植株在自然露天环境下AD的作用(图3a)。在被吸汁蚜虫感染后,WT植株不断排放VOC MeSA(图1g,h)。值得注意的是,NAC2接收植株释放的MeSA波动性较低,但是当发生源受到蚜虫攻击时,与WT接收植株相比,其表现出对蚜虫更高的吸引力(图1i-l)。与邻近的模拟发射植株相比,受蚜虫侵染的WT相邻接收植株对蚜虫的驱避性更强,而与模拟蚜虫攻击发射植株相邻的NAC2接收植株之间的蚜虫驱避性没有显著差异(图1m,n)。此外,在以接收植株喂食24小时后,WT中的蚜虫存活率降低,但NAC2接收植株的存活率没有降低(图 1o,p)。这些结果表明,一旦感知到MeSA,邻近接收植株中的MeSA生物合成是以NAC2依赖性方式调节进而介导可对抗蚜虫的AD。


扩展数据图2


图1

3. NAC2激活SAMT1转录

接下来,研究人员开始探索NAC2和MeSA生物合成之间的分子遗传机制。NAC2作为转录因子(扩展数据图3b),可以定位于细胞核中(扩展数据图3c)。随后,研究人员对有和没有蚜虫喂食的WT和NAC2植株进行了RNA测序(RNA-seq)和比较转录组分析,并鉴定了许多潜在的NAC2调节差异表达基因(扩展数据图4和补充表1和2),其中SAMT1的结果特别令人感兴趣(扩展数据图4e)。无论这些植物是否受到蚜虫的侵袭,NAC2植株的SAMT1 RNA水平都低于WT植株(补充表1和2)。众所周知,SAMT1将SA转化为MeSA19,研究人员通过定量研究NAC2、HA-NAC2过表达和WT植株叶片组织中的SAMT1转录本,以评估NAC2是否通过调节SAMT1的转录表达。结果表明,与WT植株相比,NAC2植株的SAMT1 mRNA水平显著降低,但HA-NAC2过表达植株的SAMT1 mRNA水平升高(扩展数据图3d,e)。此外,荧光素酶报告基因实验表明,NAC2增强了SAMT1启动子控制下的报告基因的转录(扩展数据图3f)。ChIPqPCR、酵母单杂交和EMSA分析均表明,NAC2与SAMT1启动子结合,并激活报告基因转录(扩展数据图3g-i)。此外,NAC2的瞬时过表达增加了植物MeSA的产生(扩展数据图 3j)。这些结果表明,NAC2-SAMT1模块与植物MeSA生物合成的调控有关。


扩展数据图3

扩展数据图4

4. SA激活NAC2-SAMT1模块引发AD

为了研究NAC2是否通过激活SAMT1转录影响接收植株MeSA的产生,研究人员评估了不同处理条件下突变株NAC2、NahG和WT植株中的NAC2和SAMT1的mRNA水平(图 2f)。蚜虫侵袭后,WT和NAC2植株的SA水平升高程度相近,然而,细胞MeSA和SAMT表达的增加仅在WT植株中发现(图2e-g)。在WT接收植株和NAC2接收植株邻近蚜虫侵袭植株中也发现了类似的结果(图 2h-j)。这些结果表明,NAC2是蚜虫定向诱导或蚜虫介导的SAMT1表达和挥发性MeSA产生所必需的。此外,外源性SA上调了NAC2和SAMT1在WT植株中的表达,但在NAC2突变株中SAMT1 mRNA的表达水平未显著改变(图 2k,l)。与NAC2突变株相比,外源性SA也诱导WT植株的MeSA挥发性和蚜虫驱避性(图2m–p),并增加SAMT1-KO植株中NAC2和SAMT1转录本的水平(图 2q;图2b,c),samt1植株对蚜虫的吸引力也更强,而且在samt1植株中外源性SA不诱导蚜虫驱避(图2r-t)。此外,暴露于蚜虫侵袭的samt1植株中挥发性MeSA的产生减少(图3a,b),在进一步的蚜虫行为学实验中,研究人员发现与邻近模拟的WT接收植株相比,邻近蚜虫侵袭的WT发射植株的WT接收植株对蚜虫的驱避性更强,然而,无论何时将这些发射植株暴露于蚜虫侵袭中,与NAC2或SAMT1发射植株相邻的WT接收植株在蚜虫驱避性方面都没有显著差异(图3c-e)。这些结果进一步证实了MeSA作为植物AD中PPC信号的作用。总的来说,结果表明SA可以激活NAC2-SAMT1转录进而增加发射和接收植株中挥发性MeSA的产生。

作为一种SA结合蛋白,SABP2也可以与MeSA结合,这对于细胞内MeSA转化为SA至关重要。因此,SABP2可以作为一种OBP样受体,感知并将发射植株产生的挥发状态MeSA转化为SA以触发NAC2介导的接收植株中的蚜虫抗性。为了验证这一想法,研究人员首先确认SABP2与SA结合(图3f),通过竞争结合实验验证MeSA是否影响SABP2-SA的结合活性(图3g)。在无MeSA的情况下,SABP2-[3H]SA(50 Ci mmol−1)结合力为100%。然而,在相同的实验条件下,3nM和15nM的MeSA,SABP2对[3H]SA的结合活性分别降低到约74%和46%(图3g)。因此,3nM的MeSA足以满足用于[3H]SA与SABP2的竞争结合实验,表明MeSA可以以生理浓度与SABP2结合。随后,研究人员建立了SABP2-KO突变株(sabp2),并测试了sabp2突变株与WT植株的蚜虫驱避性,用挥发性的MeSA处理,然后进行通气,挥发性的MeSA处理可增加WT的蚜虫驱避性和SA生物合成,但对于sabp2突变株并没有增加(图3h-j和扩展图2d)。此外,蚜虫喂食WT发射植株增加了WT植株的蚜虫驱避性,但sabp2未增加(图3k)。此外,外源性的SA对WT和sabp2植株的MeSA挥发性无显著差异,表明SABP2对MeSA的释放不是必须的(图3l,m)。这些结果表明,SABP2确实是一种OBP样受体,可以感知并将空气中的MeSA转化为SA,引起NAC2介导的蚜虫驱避性。

SAMT1是植物抗病毒免疫所必需的。为了测试SAMT1是否为NAC2介导的植物抗病毒免疫中的一个组成部分。研究人员敲低(KD)samt1植株中的NAC2,使用基于烟草脆裂病毒(TRV)诱导的基因沉默产生nac2/samt1双突变植株。与NAC2突变株一样,NAC2-KD植株表现出正常生长,和对CMV和PVY的高易感性(图1e-j,扩展数据图5a-e,h-l),表明病毒诱导的基因沉默NAC2-KD与NAC2-KO株有相似性。然而,nac2/samt1和samt1植株表现出相似程度的CMV或PVY易感性(图 5a-e,h-l)。此外,CMV感染增强了植物细胞内MeSA水平(扩展数据图5f)。在病毒感染期间,NAC2-KD、samt1和nac2/samt1植株的未侵袭叶片产生相似数量的MeSA,但与WT植株相比,数量较低(扩展数据图5g)。此外,作者还研究了外源性MeSA或SA在nac2、sabp2、samt1和WT不同植株中,MeSA是否以及如何通过NAC2介导植物抗病毒防御。与WT植株相比,nac2、samt1和sabp2植株对CMV和PVY更易感(图3n,o)。然而,外源性MeSA可以降低nac2和samt1植株的病毒易感性,但对sabp2植株无效(图 3n,o),可能是由于WT、nac2和samt1植株中的MeSA转化为 SA。外喷SA也可以降低nac2、samt1和sabp2植株的病毒易感性(图3n,o)。这与以下事实一致:SA可以抑制多种病毒对植物的感染,包括CMV、马铃薯病毒X和TMV。

综上所述,MeSA结合蛋白SABP2能够在结合MeSA时,将细胞间的MeSA转化成SA。由此实现信号的发起。随后SA激活NAC2-SAMT1模块,以此上调内源MeSA水平,促进NAC2依赖性SAMT1的转录与翻译。



图2

图3

扩展数据图5
5. CMV1a破坏NAC2的稳定性以抑制AD

研究表明CMV感染可以抑制蚜虫诱导的AD(图4a),从而有利于蚜虫的生存和病毒的传播与感染,可能是通过CMV介导MeSA所致。CMV1a-NAC2相互作用(扩展数据图1a-d)表明CMV1a可能参与CMV介导的AD抑制。为了验证这一点,首先生成了表达CMV1a的转基因烟草植物(扩展数据图6a,b),并评估了CMV1a对植物、蚜虫和AD吸引力的影响。圆形培养皿和Y管嗅觉仪生物测定表明,CMV1a表达导致植物对蚜虫具有更高的吸引力(扩展数据图 6c,d)。表明CMV1a参与CMV介导的AD抑制。

为了了解 CMV1a-NAC2相互作用在CMV介导的AD抑制中的重要性,研究人员鉴定了CMV1a中与NAC2相互作用的关键氨基酸。CMV1a由N端甲基转移酶和C端ATP依赖性解旋酶结构域(HD)组成。此外,研究人员发现CMV1a HD是CMV1a-NAC2相互作用的主要区域(扩展数据图6l)。随后,研究人员使用Alpha Fold-Multimer27模拟了CMV1a-NAC2复合物的结构,并观察到 CMV1a中983位的甘氨酸残基与NAC2物理距离最近,预测该残基可能是CMV1a与NAC2相互作用所必需的(扩展数据图6m,n)。CMV1a HD或全长CMV1a中的G983D突变严重降低了CMV1a-NAC2的相互作用(扩展数据图 6o-q)。

接下来,研究人员使用BiFC研究了CMV1a-NAC2相互作用的亚细胞定位,发现CMV1a在细胞核和细胞质中都与NAC2相互作用(图1c),这与没有CMV1a共表达的NAC2定位不同(图3c),表明CMV1a可以将一些NAC2从细胞核转移到细胞质。类似的还有CMV1aMYC,但是cLUCMYC和CMV1a(G983D)-MYC均未出现这种现象,这或许可以解释引起部分RFP-NAC2的细胞质定位和细胞核中较少的RFP荧光(扩展数据图 7a)。值得注意的是,CMV1a-MYC没有改变RFP核定位,表明CMV1a-MYC定向NAC2的重新定位取决于NAC2-CMV1a相互作用(扩展数据图7b)。此外,研究人员使用核输出信号(NES)标记的NAC2研究了细胞质NAC2的稳定性。结果发现NES-NAC2定位于细胞质中,NAC2易被26S-蛋白酶体系统降解(扩展数据图7c,d)。此外,瞬时CMV1a表达增强了26S-蛋白酶体系统对NAC2的降解,但不影响RFP稳定性(扩展数据图 7e-i),而CMV1a(G983D)未引起NAC2降解(扩展数据图7f–i)。

瞬时表达试验表明,是CMV1a而非CMV1a(G983D)抑制NAC2介导的SAMT1激活启动子(扩展数据图7j)。此外,CMV1a(G983D)或CMV1a植株与WT植株的Y管嗅觉仪生物测定和GC-MS分析表明,CMV1a(G983D)降低CMV1a介导的植物对蚜虫的吸引力和抑制MeSA挥发(扩展数据图7k-m)。而且Y管嗅觉仪生物测定提供了额外的证据,证实氨基酸残基Gly983对CMV1a抑制植株间AD至关重要。

综上所述,表明CMV1a通过与NAC2的直接相互作用,影响NAC2的亚细胞定位并破坏其稳定性,从而降低转录因子NAC2驱动的SAMT1激活和MeSA的产生,进而干扰和抑制AD。



扩展数据图6


扩展数据图7

图4
6. 一些蚜虫传播的病毒抑制AD

CMV1a具有甲基转移酶和解旋酶活性,并构成病毒复制酶复合物的一部分,通过其HD与NAC2相互作用(扩展数据图1a-d)。值得注意的是,来自许多蚜虫传播病毒的HDs,包括马铃薯Y病毒、黄蜂病毒、黄体病毒和阿尔法莫病毒在与CMV1a Gly983相对应的位置均含有保守的甘氨酸残基(扩展数据图8和9a)。

GC-MS分析显示,PVY感染并影响了蚜虫侵染后植物MeSA的挥发。此外,作者还研究了,两种蚜虫传播的病毒CMV和PVY使NAC2能够从细胞核到细胞质重新定位(扩展数据图9i)。同样,PVY CI,而不是CI(G347D)或非蚜虫传播病毒TMV的126KD蛋白,与NAC2相互作用(扩展数据图9j,k),并部分破坏NAC2的稳定性(扩展数据图9l)。这些结果表明,一些蚜虫传播的病毒已经进化到利用含HD的蛋白质作为干扰植物AD的一般策略。


扩展数据图8


扩展数据图9

结论

本研究发现蚜虫侵染植物后,植物会产生MeSA,诱导植物的抗蚜虫免疫,并降低病毒的传播。此外,还发现一些蚜虫传播病毒能够编码含有解旋酶结构域的蛋白质与NAC2蛋白相互作用,改变NAC2蛋白的亚细胞核定位至细胞质中,促使NAC2在细胞质中被26S蛋白酶体降解,从而负调控NAC2-SAMT1通路,抑制蚜虫侵染植物MeSA的合成和挥发,阻断植物间“预警”通讯,促进蚜虫对邻近植物的侵染和对病毒的传播。本研究也鉴定了识别和感知空气中MeSA的气味结合蛋白(OBP)样受体SABP2,揭示了MeSA介导植物气传性免疫的分子机制及植物病毒的反防御机制,说明了一种全新的蚜虫-病毒之间共进化的共生关系,为VOC触发PPC的详细机制奠定了基础,为未来植物与环境的适应性研究提供了方向。


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